Mapa microbiano de Chile
El 17 de Septiembre celebramos a los miembros más minúsculos de nuestra biodiversidad: los microorganismos. A pesar de su pequeño tamaño, son clave para la vida como la vemos hoy en día y en mantener los ecosistemas. Para celebrarles, en conjunto con la Red Chilena de Ecología Microbiana (RECHEM2020 en twitter) creamos un mapa microbiano de Chile. Estos microorganismos han sido identificados y caracterizados primeramente en Chile. Este ha sido un hermoso proyecto donde pude colaborar con científicas inspiradoras e ilustrar microorganismos muy interesantes! Estoy muy agradecida por esta oportunidad.
Este mapa incluye una descripción de cada cepa, puedes encontrar la lista de cada una más abajo.
Tambien puedes ver el video del lanzamiento del mapa con las científicas de RECHEM. Hemos salido tambien en la prensa y puedes revisarla en la sección de noticias.
El 17 de Septiembre celebramos a los miembros más minúsculos de nuestra biodiversidad: los microorganismos. A pesar de su pequeño tamaño, son clave para la vida como la vemos hoy en día y en mantener los ecosistemas. Para celebrarles, en conjunto con la Red Chilena de Ecología Microbiana (RECHEM2020 en twitter) creamos un mapa microbiano de Chile. Estos microorganismos han sido identificados y caracterizados primeramente en Chile. Este ha sido un hermoso proyecto donde pude colaborar con científicas inspiradoras e ilustrar microorganismos muy interesantes! Estoy muy agradecida por esta oportunidad.
Este mapa incluye una descripción de cada cepa. Para leer más puedes hacer click en el “!” que está junto al nombre de cada especie en el mapa (sino sale actualiza la página), o puedes encontrar la lista más abajo.
Tambien puedes ver el video del lanzamiento del mapa con las científicas de RECHEM. Hemos salido tambien en la prensa y puedes revisarla en la sección de noticias.
Lista de especies microbianas
Lanzamiento con las científicas de RECHEM
Zona norte
Pseudomonas arsenicoxydans
Texto imagen:
Pseudomonas arsenicoxydans sp. nov. , la bacteria metaloide
Esta bacteria fue aislada desde sedimentos con altos niveles de arsénico en la Quebrada de Camarones en el Desierto de Atacama.
Es una bacteria Gram negativa de forma bacilar, aerobia obligada (requiere de oxígeno para respirar). Tiene un flagelo polar múltiple que le permite movilizarse.
Esta bacteria” metaloide” es capaz de oxidar el arsenito y transformarlo a arsenato, una característica que le permite aprovechar este metaloide tóxico y que le dió origen a su nombre “Pseudomonas arsenicoxydans” lo que las diferencia de otras Pseudomonas cercanas filogenéticamente (es decir emparentadas).
Estudio de referencia:
Campos, V., Valenzuela, C., Yarza, P., Kämpfer, P., Vidal, R., Zaror, C., Mondaca, M.A., Lopez-Lopez, A., Rosselló-Móra, R. (2010). Pseudomonas arsenicoxydans sp. nov., an arsenite-oxidizing strain isolated from the Atacama desert. Systematic and Applied Microbiology, 33(4), 193-197.
Enibas tolerabilis
Texto:
Enibas tolerabilis, Coanoflagelados de las Alturas
Es un microorganismo eucarionte acuático aislado desde el Salar de Ascotán ubicado a 3750 metros sobre el nivel del mar. Mide aproximadamente 10 µm , se envuelve de una “armadura” llamada lorica y cuenta con un flagelo que le permite nadar. Se alimenta de otros microorganismos más pequeños.
Este flagelado es muy tolerante, vive en las condiciones extremas del Altiplano Chileno, caracterizadas por una alta radiación ultravioleta, abruptos cambios de temperatura entre el día y la noche y gradientes salinos. En efecto, se le denominó “tolerabilis” por su gran tolerancia a vivir desde condiciones de agua dulce a aguas muy salinas, equivalentes al doble de la sal que se encuentra en el agua de mar. Aguas que también contienen iones tóxicos para otros organismos, como son el arsénico y el litio.
Estudio de referencia:
Schiwitza, S., Arndt, H., & Nitsche, F. (2019). First description of an euryoecious acanthoecid choanoflagellate species, Enibas tolerabilis gen. et sp. nov. from a salar in the Chilean Andes based on morphological and transcriptomic data. European Journal of Protistology, 67, 106-113.
Pseudomonas atacamensis
Texto imagen:
Pseudomonas atacamensis sp nov, Bacteria del desierto florido
Esta bacteria atacameña fue aislada desde rizósfera de plantas del desierto florido. Corresponde a una bacteria Gram-negativa de forma bacilar, aeróbica (utiliza oxígeno para respirar materia orgánica) y es móvil, ya que posee un largo flagelo casi de su mismo tamaño.
Asi como otros microorganismos del desierto es muy versátil y puede resistir altas concentraciones de metales y ayudar a promover el crecimiento de la flora del desierto.
Por lo mismo, los investigadores consideran a esta pequeña como una gran ayuda para recuperar suelos contaminados y promover el crecimiento vegetal.
Estudio de referencia:
Poblete-Morales, M., Carvajal, D., Almasia, R. et al. Pseudomonas atacamensis sp. nov., isolated from the rhizosphere of desert bloom plant in the region of Atacama, Chile. Antonie van Leeuwenhoek 113, 1201–1211 (2020). doi: 10.1007/s10482-020-01427-0
Zona centro
Corynebacterium alimapuense
Texto imagen:
Corynebacterium alimapuense sp. nov. , Bacteria porteña
Esta bacteria fue aislada desde sedimentos marinos de la bahía de Valparaíso a 19 metros de profundidad, precisamente recibe el nombre de “alimapuense” por pertenecer a Alimapu (tierra quemada) nombre que recibieron las tierras porteñas en Mapudungún.
Este Actinomicete es Gram-positivo de forma “cocobacilar”, no es móvil, es anaeróbica facultativa, (respira materia orgánica con y sin oxígeno lo cual es muy útil para vivir en un sedimento marino. A diferencia de otras Corynebacterium, esta bacteria ama a la sal por lo que es “ marina obligada”. Esto significa que sólo podrá crecer si su medio de cultivo contiene agua de mar o esté suplementado con sal.
Estudio de referencia:
Claverías, F., Gonzales-Siles, L., Salvà-Serra, F., Inganäs, E., Molin, K., Cumsille, A., Undabarrena, A., … & Cámara, B. (2019). Corynebacterium alimapuense sp. nov., an obligate marine actinomycete isolated from sediment of Valparaíso bay, Chile. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 69(3), 783-790.
Megavirus chilensis
Texto imagen:
Megavirus chilensis, Un virus gigante
Este virus fue aislado desde el agua de mar de las costas de Valparaíso en Las Cruces. Este Megavirus es capaz de infectar amebas, por ejemplo la Acanthamoeba sp., un microorganismo eucarionte de agua dulce.
Es un virus nucleocitoplasmáticos de ADN de gran tamaño (680 nm) y fue nombrado con el prefijo Mega, ya que su genoma de doble hebra (dsDNA) supera una megabase que codificarían para más de 1000 proteínas.
Sus descubridores propusieron clasificarlo en una nueva familia “Megaviridae” al International Committee on Taxonomy of Viruses , sin embargo hasta el día de hoy no está asignado a ninguna familia.
Estudio de referencia:
Arslan, D., Legendre, M., Seltzer, V., Abergel, C., & Claverie, J. M. (2011). Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. Proceedings of the National Academy of Sciences, 108(42), 17486-17491.
Halomonas nitroreducens
Texto imagen:
Halomonas nitroreducens, Bacteria salina
Esta bacteria fue aislada de las Salinas de Cahuil, ubicadas en la Región del Libertador Bernardo O´Higgins, en Chile. Las salinas se generan en lagunas artificiales construidas para evaporar el agua y obtener cristales de sal de mar (sal de Cahuil).
Esta bacteria “salina” recibe su nombre “nitroreducens” por ser capaz de respirar nitrato y nitrito en ausencia de oxígeno. Es muy tolerante a la sal, por lo que se le denomina halófila, vive en condiciones dos veces más salinas que el agua de mar (5–7.5 % NaCl).
Además, soporta un rango amplio de temperatura (4 °C a 45 °C, resistiendo al calor de 80 °C por hasta 10 minutos) y de pH (5 a 10), por lo que se puede considerar que es una poli-extremófila.
Estudio de referencia:
González-Domenech et al. (2008) Int J Syst Evol Microbiol 58, 872
Acidiferrimicrobium australe
Texto imagen:
Acidiferrimicrobium australe gen. nov., sp. nov., Bacteria minera
Esta bacteria fue aislada desde agua de drenaje ácido contaminada por metales, en la mina de carbón subterránea abandonada “Trongol” ubicada en Curanilahue (Región del Biobío).
Esta bacteria es Gram-positiva, móvil, tiene forma de bacilo corto, respira materia orgánica (heterótrofa), sin embargo también obtiene energía desde el hierro. Esta bacteria minera utiliza el metal hierro con y sin presencia de oxígeno, en condiciones aeróbicas oxida el hierro ferroso y en condiciones anaeróbicas reduce el hierro férrico. Esto puede hacerlo por que vive en condiciones tan ácidas como el jugo de un limón (pH <3.0).
A. australe constituye una nueva especie y un nuevo género dentro de la familia Acidimicrobiaceae.
Estudio de referencia:
González, D., Huber, K. J., Tindall, B., Hedrich, S., Rojas-Villalobos, C., Quatrini, R., … & Nancucheo, I. (2020). Acidiferrimicrobium australe gen. nov., sp. nov., an acidophilic and obligately heterotrophic, member of the Actinobacteria that catalyses dissimilatory oxido-reduction of iron isolated from metal-rich acidic water in Chile. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 70(5), 3348-3354.
Zona sur
Ca. Marithioploca araucae
Texto imagen:
Ca. Marithioploca araucae, Megabacterias del “Sulfureto de Humboldt”
Esta bacteria gigante, fue descubierta en 1962 en sedimentos anóxicos del Pacífico Sudoriental, las actualmente llamadas Marithioploca viven en grupo formando un ramillete envuelto por una vaina externa que se aprecia a simple vista, como un paquete de tallarines. Donde albergan a otros microorganismos.
Es una Gram-negativa, puede alcanzar más de 20 cm de largo. En vez de respirar oxígeno ellas usan el nitrato que abunda en las aguas del fondo marino. Lo almacenan en vacuolas y luego migran en busca de su fuente de energía que obtienen del ácido sulfhídrico que se acumula por la condición anóxica (sin oxígeno) en la parte más profunda del sedimento.
Estudio de referencia:
Gallardo, V. A., Espinoza, C., Fonseca, A., & Musleh, S. (2013). Las grandes bacterias del Sulfureto de Humboldt. Gayana (Concepción), 77(2), 136-170.
Campylobacter ornithocola
Texto imagen:
Campylobacter ornithocola sp. nov., Bacteria “emplumada”
Bacteria aislada desde fecas de aves silvestres en parques urbanos públicos en la ciudad de Valdivia, posiblemente asociadas a especies endémicas como bandurrias australes (Theristicus melanopis), queltehues (Vanellus chilensis) y tiuques (Milvago chimango).
Es una bacteria Gram-negativa, con forma de bacilo curvado, no encapsulado, es heterótrofa adaptada a vivir dentro de otro organismo, por su tolerancia a bajos niveles de oxígeno (microaerobia).
Esta bacteria “emplumada” recibe su nombre en alusión a su origen: “habitante de las aves”, sin embargo aún no se sabe si es patógena (como otras Campylobacter) o si simplemente es parte del microbioma de estas hermosas aves tan características del sur de nuestro país.
Estudio de referencia:
Cáceres, A., Muñoz, I., Iraola, G., Díaz-Viraqué, F., & Collado, L. (2017). Campylobacter ornithocola sp. nov., a novel member of the Campylobacter lari group isolated from wild bird faecal samples. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 67(6), 1643-1649.
Rhodotorula nothofagi
Texto imagen:
Rhodotorula nothofagi sp. nov., Levadura leñadora
Este microorganismo es un eucarionte, específicamente una levadura que fue aislada desde un tronco de roble en descomposición en Futrono (Valdivia). El roble (Nothofagus obliqua) es un árbol nativo de nuestro territorio que habita principalmente en el sur.
Esta levadura “leñadora” es un basidiomicete carotenogénica no fermentativa, que forma colonias de color amarillo-ocre, opacas, lisas, con márgenes ligeramente bordeados por crecimiento micelial sumergido.
A diferencia de otras levaduras, sólo se conoce su fase asexual (anamórfica). Para conocer su fase sexual (teleomórfica) los investigadores realizan experimentos de apareamiento, ya que esta fase del ciclo de vida se inicia con la conjugación (que es como un puente que conecta dos células compatibles donde intercambian material genético), seguida de la producción de micelio. Esta fase en la naturaleza ocurre cuando las condiciones ambientales son adecuadas, y se producen basidios y basidiosporas permitiendo la diseminación del organismo.
Estudio de referencia:
Sampaio, J. P., Golubev, W. I., Fell, J. W., Gadanho, M., & Golubev, N. W. (2004). Curvibasidium cygneicollum gen. nov., sp. nov. and Curvibasidium pallidicorallinum sp. nov., novel taxa in the Microbotryomycetidae (Urediniomycetes), and their relationship with Rhodotorula fujisanensis and Rhodotorula nothofagi. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 54(4), 1401-1407.
Zona Austral, Antártica
Rhodotorula nothofagi sp. nov.
Texto imagen:
Rhodotorula portillonensis sp. nov., Levadura Antártica
Este es un microorganismo eucarionte fue aislado desde sedimentos marinos de aguas poco profundas en la Bahía Fildes, Isla Rey Jorge, Antártica.
Esta levadura “Antártica” presenta formas subglobosas a esféricas, estan solas o formando parejas. Sus colonias son brillantes, mucoides y lisas, con márgenes enteros y presentan por lo general un color rosa. A diferencia de otras levaduras, esta especie no puede asimilar sacarosa. La investigadora que la descubrió la llamó Rhodotorula portillonensis con el nombre de su pueblo natal “Portillo en Castilla y León, España.
Estudio de referencia:
Laich, F., Vaca, I., & Chavez, R. (2013). Rhodotorula portillonensis sp. nov., a basidiomycetous yeast isolated from Antarctic shallow-water marine sediment. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 63(10), 3884-3891.
Amycolatopsis antarctica sp. nov.
Texto imagen:
Amycolatopsis antarctica sp. nov., Bacteria Surfista
Es una bacteria Actinobacteria que fue aislada desde la superficie de una macroalga parada (Adenocystis utricularis), recolectada en el sitio de Punta Rodríguez en la Isla Rey Jorge (Islas Shetland del Sur, Península Antártica). adaptada a vivir a las condiciones extremas de la Antártica.
Esta bacteria “surfista” porque vive en la superficie de la macroalga, es capaz de formar extensiones de “micelios” ramificados que se fragmentan como varillas y otras estructuras proyectadas, denominadas “hifas” aéreas cortas y con una espiral cerrada y compacta en la punta.
Esta psicrófila moderada crece a temperaturas de 4°C a 28°C y halófila obligada (sólo crece con sal).
Estudio de referencia:
Wang, J., Leiva, S., Huang, J., & Huang, Y. (2018). Amycolatopsis Antarctica sp. nov., isolated from the surface of an Antarctic brown macroalga. International journal of systematic and evolutionary microbiology, 68(7), 2348-2356.
